古写真資料館
明治・大正期の長崎に関する写真が展示されています
埋蔵資料館
市指定有形文化財「東山手洋風住宅群」を活用した資料館。
長崎原爆資料館
展示スペースはらせん通路を下った地下1階に設けられています
長崎歴史文化博物館
海外交流史に関する資料、工芸品、美術品などが展示されています
西海市大瀬戸歴史民俗資料館
資料館には家船の模型が展示されています
南島原市口之津歴史民俗資料館・海の資料館
口之津の先祖が残した遺産が展示されています
駄菓子屋さん博物館
館主が長年かけて集めたコレクションの数々が展示されています
佐世保市博物館島瀬美術センター
佐世保市の文化遺産が紹介されています
平戸市切支丹資料館
当地には弥生時代の遺跡があり、出土品も展示されています
松浦史料博物館
旧藩主松浦氏の旧邸を利用した博物館
平戸市生月町博物館・島の館
研修、見学なども行われています
長崎県立対馬歴史民俗資料館
朝鮮通信使や対馬の歴史史料などが展示されている資料館